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1954年7月，博鱼官方登录入口前身“中国医药博鱼官方登录入口常州市博鱼官方登录入口”正式成立。后更名为江苏省常州医药药材博鱼官方登录入口，即江苏省医药博鱼官方登录入口常州采购供应站。
1993年11月，经江苏省经济体制改革委员博鱼综合体育app平台官网批准，在原江苏省常州医药药材博鱼官方登录入口的基础上进行整体改制设立定向募集股份有限博鱼官方登录入口——常州药业股份有限博鱼官方登录入口。
1994年2月，博鱼官方登录入口兼并国有博鱼官网登录入口常州健民制药厂。
1997年9月，博鱼官方登录入口兼并国有博鱼官网登录入口常州制药厂。
2000年7月，上海实业医药投资股份有限博鱼官方登录入口通过收购常州药业的2310万股法人股，持股42%。
2002年，上海实业医药投资股份有限博鱼官方登录入口通过配股1848万股增资6190.8万元，持股55.75%，成为控股股东。
2005年7月，博鱼官方登录入口在原有5个批发分博鱼官方登录入口的基础上，组建常州药业股份有限博鱼官方登录入口医药药材分博鱼官方登录入口。
2010年3月，上海实业医药投资股份有限博鱼官方登录入口因重大资产重组被上海医药集团股份有限博鱼官方登录入口吸收合并，博鱼官方登录入口控股股东变更为上海医药集团股份有限博鱼官方登录入口。
2010年11月，上海医药集团股份有限博鱼官方登录入口下属的控股博鱼官方登录入口——上海实业联合集团药业有限博鱼官方登录入口以其所持有的赤峰科元投资发展有限博鱼官方登录入口51%股权对博鱼官方登录入口增资扩股，并成为博鱼官方登录入口的新股东。
2012年，博鱼官方登录入口下属常州制药厂有限博鱼官方登录入口投资1.5亿元，在江苏如东经济开发区新建原料药生产基地—南通常佑药业科技有限博鱼官方登录入口。
2012年，博鱼官方登录入口下属常州制药厂有限博鱼官方登录入口收购常州武新制药有限博鱼官方登录入口，确保了重点制剂品种“常绛”主要原料硫酸双肼屈嗪的正常供应。
2013年7月，博鱼官方登录入口完成内部职工股和社博鱼综合体育app平台官网法人股股权收购工作，解决了博鱼官方登录入口股权过于分散的问题，股东数由1459家减少为168家，上海医药集团股份有限博鱼官方登录入口直接（或间接）持有常州药业股权比例上升至75.89%。
2015年4月20日， “常州药业股份有限博鱼官方登录入口”正式更名为“博鱼官方登录入口”。
2015年7月1日，常州药业股份有限博鱼官方登录入口医药药材分博鱼官方登录入口、常州药业股份有限博鱼官方登录入口资产管理分博鱼官方登录入口整体并入博鱼官方登录入口。
2016年10月1日，总投资1.8亿元的常州药业医药物流中心一期项目顺利竣工并投入使用。
2016年12月，博鱼官方登录入口下属赤峰艾克制药科技股份有限博鱼官方登录入口、赤峰蒙欣药业有限博鱼官方登录入口通过实施“退城进园”项目，整体迁入新厂，并且两年内完成了老厂区土地变现工作。 2017年12月，博鱼官方登录入口下属常州制药厂有限博鱼官方登录入口制剂国际化取得历史性突破，瑞舒伐他汀钙片成功销往美国市场。
2018年7月，博鱼官方登录入口下属常州制药厂有限博鱼官方登录入口卡托普利片（25mg）业内率先通过仿制药质量和疗效一致性评价。
2018年12月，总投资1.5亿元的南通常佑药业二期工程竣工投入使用，基本消除了常州制药厂有限博鱼官方登录入口特色原料药的产能瓶颈。
2019年3月，“常药”商标被国家工商行政管理总局商标局认定为“中国驰名商标”。
2019年7月，常州药业物流中心二期项目投入运营，库区新增了立体库和自动化分拣线，仓储和配送能力常州领先。
2019年10月，博鱼官方登录入口竞得常州市天宁区凤凰公园西侧商业地块（约43亩），并成立上药东建房地产有限博鱼官方登录入口，启动博鱼官方登录入口和常药厂（联合）经营管理大楼的建设。
2020年9月，博鱼官方登录入口下属常州制药厂生产的瑞舒伐他汀钙片获得国家药监局（NMPA）批准上市，顺利实现“国内国外双市场、原料药和制剂垂直一体化”的大满贯布局。
2021年3月18日，博鱼官方登录入口商务中心项目（博鱼官方登录入口大厦）举行开工奠基仪式。
2022年7月10日，博鱼官方登录入口商务中心项目举行主楼封顶仪式。
2022年12月，博鱼官方登录入口下属常州制药厂、蒙欣药业生产的抗疫药品积极保供上海、常州，彰显国企责任担当。
2023年12月24日，博鱼官方登录入口商务中心项目（博鱼官方登录入口大厦）顺利竣工投入使用。
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